More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3280 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  93.2 
 
 		 241 aa  397  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  93.2 
 
 		 241 aa  397  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  92.72 
 
 		 241 aa  394  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  93.91 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  93.4 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  93.91 
 
 		 197 aa  381  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  92.39 
 
 		 197 aa  380  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  93.4 
 
 		 197 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  93.4 
 
 		 197 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 191 aa  94.7  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  31.29 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0252  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_126  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0048  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0117  transcriptional regulator, putative  24.67 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  28.02 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  31.11 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  43.1 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 420 aa  54.7  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  47.95 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1050  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  23 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  24 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.17 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>