More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3711 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 420 aa  809    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 213 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 215 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.65 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  32.24 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 200 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 200 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 205 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 208 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 210 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5724  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  41.67 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 210 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 239 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 217 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 226 aa  57  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 239 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 191 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0479  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  51.61 
 
 		 197 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 214 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 217 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 203 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 217 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 203 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 229 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 247 aa  55.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  52.08 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 247 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 208 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2128  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 251 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 220 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 238 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 222 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  35.37 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 207 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 210 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 219 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 241 aa  54.7  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 242 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 210 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 203 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 187 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 270 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 400 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 223 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 218 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5968  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 230 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.609129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 242 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 206 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 211 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  50 
 
 		 220 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 221 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 		 203 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 202 aa  54.3  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 220 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>