More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3636 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3340  TetR family transcriptional regulator  58.91 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  46.57 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 224 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 226 aa  91.3  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.66 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
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NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
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NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
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NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.28 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
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NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  29.02 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  25.27 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
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NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.68 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  28.72 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  31.53 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  31.68 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 244 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  29.35 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
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NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  28.21 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
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NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
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