More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2049 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 257 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  33.12 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 208 aa  87.8  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  26.9 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.63 
 
 		 230 aa  85.1  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 234 aa  84.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 226 aa  84.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.41 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.16 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  30.32 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  27.46 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  29.38 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  32.31 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  30.16 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.23 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  36.84 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  29.73 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
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