More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3340 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3340  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
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NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  61.5 
 
 		 208 aa  225  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
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NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 245 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  58.91 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
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NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
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NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
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NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
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NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
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NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 208 aa  72  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
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NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  24.23 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  30.1 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  24.23 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  26.9 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
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NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  28.36 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  26.6 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  29.41 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
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NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  29.5 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 424 aa  58.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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