More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1403 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  494  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  98.34 
 
 		 270 aa  457  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  78.7 
 
 		 231 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 224 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  49.75 
 
 		 224 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 248 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 223 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 222 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 217 aa  89  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 230 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3340  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  28.99 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 211 aa  72  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
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NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  31.45 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  30.1 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  25.9 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  25.9 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
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