71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1050 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1050  transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0048  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  21.26 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  21.26 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 241 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 240 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 251 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  22.32 
 
 		 275 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  36.21 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 288 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 259 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 248 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3299  TetR family transcriptional regulator  20.93 
 
 		 204 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 206 aa  42  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 191 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 193 aa  42  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 258 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  19.44 
 
 		 227 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 232 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 227 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 196 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 222 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  40.8  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>