More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1634 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  69.19 
 
 		 190 aa  252  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 295 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  35.05 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 223 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.43 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 125 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  41.79 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  28.17 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  50.94 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  50.94 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  35.8 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  26.74 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>