More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3612 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  98.48 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  95.94 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  94.92 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  94.42 
 
 		 241 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  94.42 
 
 		 241 aa  381  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  93.91 
 
 		 206 aa  381  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  94.42 
 
 		 197 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  94.92 
 
 		 197 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  93.91 
 
 		 241 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  28.83 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0252  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_126  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0117  transcriptional regulator, putative  25.17 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0048  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  26.37 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
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NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  25.98 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  23.76 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1050  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  41.38 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  41.38 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 238 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 273 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
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NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 232 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
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NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
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NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
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NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
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NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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