More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1312 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  408  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 211 aa  97.1  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.5 
 
 		 220 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 220 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  32.39 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  31.58 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  31.19 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  45.26 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  25.28 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 259 aa  72  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.81 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.47 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  40.43 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  26.62 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
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NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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