129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1946 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  54.4 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 211 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 205 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  26.26 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  40 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  27.01 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  28.85 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  27.12 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  33.96 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 206 aa  51.2  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  44.07 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  44.07 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 219 aa  47.8  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  23.39 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  24.14 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  27.85 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  22.54 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  21.98 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  26.11 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  40.74 
 
 		 210 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0300  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  25.54 
 
 		 188 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  25 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1262  hypothetical protein  22.52 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.683399  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26420  hypothetical protein  18.23 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  35.42 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>