109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0247 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 184 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  29.38 
 
 		 210 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  29.1 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3180  putative transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  24.18 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  57.14 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  23.47 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  24.18 
 
 		 184 aa  51.2  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0844  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  40 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  24.22 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  24.1 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  24.4 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2575  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2629  regulatory protein TetR  29.08 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  20.38 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  25.57 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  26.47 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  41.27 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  23.38 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  23.81 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  25 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  20.22 
 
 		 228 aa  45.1  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0079  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0990564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  43.48 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  51.35 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  27.54 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  19.39 
 
 		 186 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2537  putative transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 203 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>