175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27720 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  28.96 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  42.42 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  42.42 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  47.69 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  23.98 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  37.5 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  42.42 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  44.83 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  32.86 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  25.82 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  35.29 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  32.56 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  22 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  22 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18610  transcriptional regulator, tetR family  46.51 
 
 		 89 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  29.07 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  25.84 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>