34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26420  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  395  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  28.4 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2537  putative transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 203 aa  94.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1714  hypothetical protein  26.71 
 
 		 152 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  25.15 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  21.56 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  21.56 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  21.56 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  21.56 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  21.56 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  20.96 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  24.71 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0969  putative transcriptional regulator, TetR family  17.78 
 
 		 214 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.043647  hitchhiker  0.0000349278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  28.16 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  21.56 
 
 		 289 aa  47.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1048  probable dihydroxyacetone kinase regulator  22.39 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65862e-21 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0287  hypothetical protein  20.27 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.356291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  25 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  18.23 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  22.94 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  20.97 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  21.97 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  20.12 
 
 		 187 aa  42  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  20.11 
 
 		 177 aa  42  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  22.12 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>