29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2537 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2537  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  427  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  30.36 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26420  hypothetical protein  29.88 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1714  hypothetical protein  29.33 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0969  putative transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.043647  hitchhiker  0.0000349278 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04190  transcriptional regulator, tetR family  29.05 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.584897 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0254  hypothetical protein  27.91 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  27.91 
 
 		 289 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  21.05 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  33.67 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  23.21 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  22.52 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  22.52 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  22.52 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  22.52 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  38.64 
 
 		 189 aa  42  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 177 aa  42  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 183 aa  41.2  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>