132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00610 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  429  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  24.43 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  25 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  23.16 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  23.16 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  23.16 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  23.16 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  23.28 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  24.71 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  25.57 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  25 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  23.37 
 
 		 246 aa  52  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  22.81 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2537  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  50.94 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  21.25 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  26.74 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  22.81 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  23.03 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  19.14 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  40.82 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  22.44 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1048  probable dihydroxyacetone kinase regulator  21.83 
 
 		 164 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65862e-21 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  24.4 
 
 		 189 aa  44.7  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26420  hypothetical protein  22.94 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  21.43 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3307  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0386151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  23.37 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>