87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3055 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  72.08 
 
 		 197 aa  288  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  58.92 
 
 		 186 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  58.92 
 
 		 186 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  58.92 
 
 		 186 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  22.83 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  27.33 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  22.68 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  19.57 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  19.57 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  21.26 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  20.79 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  20.79 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  20.73 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  32.81 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  19.64 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 		 228 aa  44.7  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  31.43 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  33.8 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  31.43 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  36.51 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  30 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  42.22 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  30 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3278  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  39.62 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  23.74 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  25.87 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0844  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  21.38 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  24.29 
 
 		 175 aa  42  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  17.96 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 191 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  21.38 
 
 		 188 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  19.41 
 
 		 205 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  18.45 
 
 		 219 aa  42  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 225 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 188 aa  42  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 188 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  19.41 
 
 		 205 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  19.41 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 305 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  21.38 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  21.38 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>