106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0483 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  352  1e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3307  transcriptional regulator, TetR family  19.63 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0386151  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 228 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 191 aa  51.6  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 194 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0287  hypothetical protein  37.93 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.356291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  23.36 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 207 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  22.54 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  26.22 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1608  transcriptional regulator  25 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0667725  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 398 aa  48.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 211 aa  47.8  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  21.23 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  26.79 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  26.67 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0844  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  26.19 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2558  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  44.7  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 199 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  23.08 
 
 		 205 aa  44.7  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  23.46 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0774  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  25 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 212 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  21.99 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  19.75 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  20.23 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  22.99 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  25.14 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  22.86 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  21.79 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  19.75 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  21.32 
 
 		 388 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  20.9 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  19.49 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  28.33 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 250 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  21.64 
 
 		 213 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 184 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 201 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 178 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 174 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 190 aa  42  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 187 aa  42  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  21.85 
 
 		 181 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 184 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 207 aa  42  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  22.47 
 
 		 184 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 211 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2397  regulatory protein, TetR  32.86 
 
 		 225 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 212 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  19.67 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 310 aa  41.2  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  19.77 
 
 		 213 aa  41.2  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  22.52 
 
 		 248 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  19.78 
 
 		 234 aa  40.8  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  19.78 
 
 		 215 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  19.78 
 
 		 234 aa  40.8  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  19.78 
 
 		 234 aa  40.8  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  19.78 
 
 		 215 aa  40.8  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  19.78 
 
 		 234 aa  40.8  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>