159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2738 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  79.56 
 
 		 181 aa  304  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2292  hypothetical protein  93.46 
 
 		 155 aa  296  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861673  hitchhiker  1.17922e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 228 aa  62  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  36.99 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  27.68 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  25.61 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  35.82 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  24.16 
 
 		 181 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 228 aa  50.8  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 192 aa  50.8  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18610  transcriptional regulator, tetR family  36.07 
 
 		 89 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  28.4 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  29.17 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  23.86 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  39.68 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  26.75 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  37.18 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  24.24 
 
 		 289 aa  48.5  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  31.4 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  36.23 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  22.81 
 
 		 221 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0956  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  42 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  34.62 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>