More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3870 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  66 
 
 		 201 aa  266  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  65.46 
 
 		 200 aa  259  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  65.48 
 
 		 200 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  59.79 
 
 		 211 aa  241  7e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  38.58 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  29.8 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  32.67 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  32 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  30.6 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30.61 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 256 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 438 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  23.36 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5848  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.143207 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  19.77 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  27 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  27.47 
 
 		 251 aa  48.5  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 241 aa  48.5  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 257 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>