More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2195 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  70.95 
 
 		 225 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  76.8 
 
 		 227 aa  327  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7122  TetR family transcriptional regulator  71.76 
 
 		 219 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3610  TetR family transcriptional regulator  73.53 
 
 		 229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0088  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  23.59 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1026  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  36.51 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3458  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  21.79 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 372 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  40.22 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 235 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 235 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1710  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 283 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  43.1 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  43.1 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
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