197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6422 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  51.42 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 		 199 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  32.26 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  34.03 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  30.5 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  41.86 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 179 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 185 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 184 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 299 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 184 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  38.55 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  28.14 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  32.56 
 
 		 390 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>