More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5848 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5848  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.143207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  31.17 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  30.92 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 438 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  25.13 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  39.33 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 260 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0215  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  32.7 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  29.31 
 
 		 237 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  42.67 
 
 		 234 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.72 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  39.34 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  39.34 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3704  regulatory protein TetR  36.92 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 217 aa  45.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 243 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>