More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4877 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  44.93 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  56 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  49.09 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  49.09 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  34.02 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03060  transcriptional regulator, tetR family  34.62 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  48.98 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  59.09 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  29.14 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  40.74 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  44 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  43.33 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  60.98 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  37.5 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>