More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5330 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  363  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  161  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  49.73 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  53.37 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 198 aa  147  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  50.57 
 
 		 203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  51.14 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  45.4 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  39.02 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  36.43 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.32 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 175 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  32.52 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  26.49 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  38.81 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 248 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>