266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14390 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 183 aa  357  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  41.1 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  41.85 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  40.76 
 
 		 208 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 191 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 191 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 191 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  37.57 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  32.09 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  57.78 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 236 aa  52  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 252 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 242 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  29.51 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 257 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 280 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  59.46 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 214 aa  48.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 226 aa  47.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 236 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 192 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  29.1 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05630  transcriptional regulator  46.34 
 
 		 90 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4631  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  46.3 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 217 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 217 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 218 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  38.18 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 332 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>