More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4864 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  40.09 
 
 		 262 aa  158  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 247 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03060  transcriptional regulator, tetR family  36.21 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  30.12 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  29.79 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  25.68 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 187 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 198 aa  52  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.54 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  40.54 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.54 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  32.85 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.54 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.54 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  40.54 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.54 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.54 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  32.69 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  30.37 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 446 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 310 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  42.31 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  51.22 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  31.33 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2995  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>