279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3700 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 198 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  45.95 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  40.21 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 		 202 aa  98.2  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  41.3 
 
 		 208 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  39.29 
 
 		 183 aa  91.3  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  32.6 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  38.35 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  30.67 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  28 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 289 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 252 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 247 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 385 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 247 aa  52.4  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 257 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 255 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  30.94 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 237 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 246 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  32.47 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>