More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5885 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  51.81 
 
 		 200 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  48.91 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  43.16 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  31.72 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  30.48 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  49.3 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  30.37 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  47.3 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>