More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4397 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  47.78 
 
 
206 aa  177  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  50.26 
 
 
200 aa  164  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  40.45 
 
 
210 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 
230 aa  98.2  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  45.7 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  36.96 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 
208 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 
199 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  51.04 
 
 
235 aa  87.8  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
289 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 
234 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 
202 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  35.26 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  34.3 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  32.07 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  43.7 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  32.47 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
241 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  38.84 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  58.62 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
247 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
212 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  33.14 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
252 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.394377 
 
 
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NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 
246 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.811394 
 
 
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