More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2370 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  30.39 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  30.43 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  29.91 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  32.77 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  27.46 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  48.21 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  29.95 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  35.97 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4072  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.860631  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  54.35 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2270  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  40.32 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>