More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8533 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  390  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  43.92 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  42.49 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  41.06 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  37.24 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  43.7 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  73.21 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  43 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  52.81 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  35.41 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  35.37 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  42.61 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  47.47 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  62.07 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  58.62 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  59.65 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  48.75 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.19 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  48.86 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  45.26 
 
 		 262 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>