163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05630 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05630  transcriptional regulator  100 
 
 		 90 aa  187  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  57.14 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 262 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 206 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 210 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 251 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 237 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  54.76 
 
 		 257 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  52.5 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 310 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  48.78 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 307 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 211 aa  47.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 202 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 190 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 247 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 227 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  46.34 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  52.5 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5244  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5332  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.199817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5623  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.63347  normal  0.363092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 208 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 233 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 208 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 217 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 236 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 212 aa  43.9  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 212 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 192 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.95 
 
 		 200 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 230 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 243 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  40.48 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  40.48 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03060  transcriptional regulator, tetR family  36.67 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 243 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  55.88 
 
 		 190 aa  42  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  38.33 
 
 		 248 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 196 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 196 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 196 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  32.61 
 
 		 221 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 183 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 446 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 216 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 214 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 200 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 252 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 212 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 192 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 196 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 242 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  48.72 
 
 		 197 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>