More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5244 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5244  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5623  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.63347  normal  0.363092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5332  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.199817 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  44.5 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  33.82 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  32.49 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  38.32 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 87 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  41.77 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  37.5 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 326 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05630  transcriptional regulator  36.47 
 
 		 90 aa  53.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  36.11 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 497 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  38.71 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 305 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.32 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 266 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 251 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  34.21 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  30.23 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 255 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>