More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4272 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 191 aa  288  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  61.08 
 
 		 191 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  36.68 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  68.33 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  54.24 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  58.18 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  63.83 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  31.76 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  59.57 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  49.06 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  29.7 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 383 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 248 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  22.49 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  30 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  49.23 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.15 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>