More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2385 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 176 aa  341  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  42.07 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  46.85 
 
 		 202 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  42.99 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  34.29 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  43.24 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  62.5 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  40.38 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 231 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  36.21 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  37.3 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 247 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 247 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 209 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  27.92 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 244 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 214 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 245 aa  51.6  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 188 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 203 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  58.54 
 
 		 203 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.3 
 
 		 194 aa  50.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>