More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0075 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  41.85 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  41.3 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 237 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  39.77 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  41.13 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 383 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 204 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 200 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 194 aa  94.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  32.77 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 199 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 212 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 224 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  33.7 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  33.73 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.89 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  33.96 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  28.41 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
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NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  30.6 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
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NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
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