297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0830 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
195 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
383 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  33.52 
 
 
224 aa  61.6  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
213 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
207 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 
248 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  27.91 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  32.65 
 
 
181 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 
188 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  28.81 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
173 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
181 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
205 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
205 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
205 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
211 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
210 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
205 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
211 aa  51.2  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 
245 aa  51.2  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  32.06 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>