179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3195 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  100 
 
 
181 aa  370  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  79.56 
 
 
181 aa  304  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2292  hypothetical protein  78.95 
 
 
155 aa  250  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861673  hitchhiker  1.17922e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
201 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  23.37 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 
235 aa  63.2  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 
200 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 
190 aa  62.4  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 
193 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 
205 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  28.82 
 
 
204 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
198 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  28.48 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 
228 aa  58.2  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  42.47 
 
 
201 aa  58.2  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
207 aa  58.2  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  28.07 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 
200 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  25.13 
 
 
205 aa  55.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 
205 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
194 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 
205 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
195 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
182 aa  54.7  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
185 aa  54.3  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
207 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  40.58 
 
 
207 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  38.89 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 
226 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  25.26 
 
 
228 aa  52.8  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
181 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.84 
 
 
199 aa  52  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
202 aa  52  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 
181 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
195 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  36.71 
 
 
195 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  34.85 
 
 
202 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
219 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 
209 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  35.29 
 
 
190 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 
183 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  29.85 
 
 
193 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.09 
 
 
197 aa  48.5  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
192 aa  47.8  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  47.8  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  47.8  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18610  transcriptional regulator, tetR family  36.07 
 
 
89 aa  47.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.514394  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  32.88 
 
 
185 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.5 
 
 
210 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  33.77 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  22.47 
 
 
181 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.14 
 
 
213 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  29.41 
 
 
197 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.88 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.88 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.14 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.14 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  30.36 
 
 
234 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 
234 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
209 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  26.04 
 
 
191 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.36 
 
 
234 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  26.04 
 
 
191 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 
211 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  29.41 
 
 
213 aa  45.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
178 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  30.36 
 
 
234 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.36 
 
 
234 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>