69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6804 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
209 aa  427  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  28.09 
 
 
187 aa  54.7  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
181 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
181 aa  51.6  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
201 aa  51.6  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  24.81 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  27.35 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  24.14 
 
 
181 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  24.03 
 
 
181 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  19.8 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  21.78 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  20.79 
 
 
205 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  18.78 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
182 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  24.14 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
198 aa  45.1  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26420  hypothetical protein  19.25 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  36.07 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  24.44 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  18.78 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  25.42 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  31.67 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  33.9 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  18.78 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  22.05 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0698  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.970629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 
177 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  32.86 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  34.33 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  21.81 
 
 
181 aa  42  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 
192 aa  42  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 
200 aa  42  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
189 aa  42  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 
196 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 
240 aa  41.6  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
229 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  28.06 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
179 aa  41.6  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
225 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
216 aa  41.6  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
211 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
183 aa  41.6  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
207 aa  41.6  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.35 
 
 
482 aa  41.2  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>