More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1084 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
482 aa  1003    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.64 
 
 
480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  24.75 
 
 
489 aa  156  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.66 
 
 
504 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.22 
 
 
504 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.67 
 
 
506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.94 
 
 
649 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  24.75 
 
 
638 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.12 
 
 
620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  24.21 
 
 
526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  21.83 
 
 
628 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.55 
 
 
559 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0417  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.19 
 
 
446 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  23.76 
 
 
732 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.44 
 
 
619 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.76 
 
 
518 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.89 
 
 
640 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  21.65 
 
 
1026 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  23 
 
 
668 aa  97.8  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  23.12 
 
 
1079 aa  97.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  22.42 
 
 
756 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  25.05 
 
 
770 aa  95.9  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  23.39 
 
 
900 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.79 
 
 
485 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  21.64 
 
 
603 aa  90.5  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  22.18 
 
 
446 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.66 
 
 
492 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  23.86 
 
 
792 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  21.79 
 
 
666 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  22.88 
 
 
838 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  23.19 
 
 
655 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  24.04 
 
 
745 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  21.58 
 
 
663 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  23.19 
 
 
655 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  23.34 
 
 
655 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  23.34 
 
 
655 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  22.22 
 
 
689 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  24.08 
 
 
792 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  21.22 
 
 
623 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  23.02 
 
 
821 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2742  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.88 
 
 
606 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.280641  hitchhiker  0.000071737 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2977  Leukotriene A4 hydrolase  24.37 
 
 
623 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  normal  0.0102393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1561  M1 family peptidase  22.87 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  22.37 
 
 
816 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.21 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  22.62 
 
 
815 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  22.18 
 
 
775 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  23.55 
 
 
610 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.29 
 
 
499 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1383  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.74 
 
 
623 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381957  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.18 
 
 
456 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.99 
 
 
516 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2965  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.71 
 
 
597 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.23 
 
 
823 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1367  leukotriene A4 hydrolase  28.95 
 
 
623 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.83 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.65 
 
 
612 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.19072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1406  leukotriene A4 hydrolase  27.19 
 
 
623 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.55 
 
 
846 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.18 
 
 
536 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.04 
 
 
673 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3459  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.77 
 
 
642 aa  72.4  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04276  aminopeptidase  26.01 
 
 
670 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.8 
 
 
573 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  22.29 
 
 
793 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.21 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3470  neutral zinc metallopeptidase M1 family protein  23.29 
 
 
629 aa  70.5  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  22.6 
 
 
647 aa  70.5  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.88 
 
 
597 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  22.6 
 
 
671 aa  70.1  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.67 
 
 
481 aa  70.1  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.21 
 
 
506 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  22.41 
 
 
818 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.7 
 
 
768 aa  69.7  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  19.72 
 
 
470 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.55 
 
 
517 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.24 
 
 
822 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1551  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.21 
 
 
615 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.043081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  23.1 
 
 
681 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  21.19 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.26 
 
 
860 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2706  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.46 
 
 
605 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000383424  hitchhiker  0.0000144505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3448  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.11 
 
 
595 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.61 
 
 
527 aa  67  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2774  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.46 
 
 
605 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000499595  decreased coverage  0.000305013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5233  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.73 
 
 
1162 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2876  response regulator receiver protein  27.84 
 
 
604 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000228252  hitchhiker  0.000169705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.35 
 
 
686 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  23.26 
 
 
778 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2765  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.61 
 
 
593 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.92 
 
 
488 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  hitchhiker  0.00804197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  18.92 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.67 
 
 
551 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03140  putative cold-active aminopeptidase; secreted using a signal peptide  23.66 
 
 
643 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.18 
 
 
865 aa  64.7  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.65 
 
 
857 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.65 
 
 
857 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  23.37 
 
 
887 aa  64.3  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  21.04 
 
 
545 aa  63.9  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.37 
 
 
905 aa  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>