More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0197 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  27.98 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 181 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  38.79 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  38.79 
 
 		 181 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  28 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  25.24 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  27.53 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  23.47 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  28.42 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  28.42 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  27.78 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  28.8 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  49.12 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  27.78 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  25.95 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  44.44 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  25.93 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18600  hypothetical protein  27.27 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.989608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  23.29 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1910  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0010144  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  23.53 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>