More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1910 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1910  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  428  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0010144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0547  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  55.17 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  47.37 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 291 aa  52  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 289 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 242 aa  51.2  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  37.29 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  40.62 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 286 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 297 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 180 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 288 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  24.11 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>