36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18600 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18600  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  377  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.989608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  27.5 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 205 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  23.17 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  37.29 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  23.84 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  29.41 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  21.02 
 
 		 181 aa  42  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2143  hypothetical protein  29.55 
 
 		 871 aa  42  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  41.2  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  28.09 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  24.81 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>