241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0946 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  393  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 174 aa  185  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 181 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 194 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  30.72 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  28.49 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  57.89 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  23.63 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  28.3 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  40.54 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  42.19 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  45.59 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 252 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  39.44 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  43.55 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  19.13 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  26.23 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  26.46 
 
 		 222 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3687  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4182  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 357 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  25.41 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>