More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1897 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  52.22 
 
 		 205 aa  197  7.999999999999999e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  23.71 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  26.01 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  25.39 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  26.2 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  23.32 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  21.83 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  27.18 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  19.89 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  24.75 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  25.29 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  20.79 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  19.76 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1910  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0010144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  26.24 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  23.12 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  21.88 
 
 		 179 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  28.74 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  16.86 
 
 		 183 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 181 aa  51.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  22.83 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  31.34 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  19.59 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0595  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>