104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2424 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  26.9 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  32.26 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  22.35 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  27.49 
 
 		 184 aa  51.2  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 184 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  23.3 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  25.57 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  24.31 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  45.65 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  24.31 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  24.12 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  24.86 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  24.31 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  24.31 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  24.31 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  38.78 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  18.08 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3180  putative transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0300  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  43.14 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  39.29 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  22.86 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 195 aa  44.3  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  23.37 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  24.8 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  22.28 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  41.3 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 205 aa  42  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  27.16 
 
 		 195 aa  42  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  42 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  20.37 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2533  putative transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 219 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18600  hypothetical protein  28.09 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.989608  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>