13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2143 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0030  hypothetical protein  48.53 
 
 		 875 aa  780    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2143  hypothetical protein  100 
 
 		 871 aa  1763    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  29.99 
 
 		 1255 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2585  hypothetical protein  35.75 
 
 		 866 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3130  hypothetical protein  35 
 
 		 868 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2725  hypothetical protein  33.92 
 
 		 866 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0192734  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1722  hypothetical protein  31.18 
 
 		 774 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1746  hypothetical protein  31.18 
 
 		 774 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.333719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2915  hypothetical protein  31.71 
 
 		 866 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4360  hypothetical protein  30.17 
 
 		 719 aa  83.2  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0384  hypothetical protein  26.88 
 
 		 730 aa  63.9  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.228891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0489  membrane of secreted protein  28.8 
 
 		 835 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.590507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6170  membrane or secreted protein  26.81 
 
 		 844 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433726  normal  0.0340627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>