126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3735 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  54.19 
 
 		 189 aa  178  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4203  TetR family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4269  TetR family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4430  TetR family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  30.7 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  22.66 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 271 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 273 aa  44.7  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 208 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  28.05 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  23.12 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5422  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  22.02 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  32.14 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>