214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0905 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 183 aa  360  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  57.06 
 
 		 200 aa  160  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  40.45 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 205 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 205 aa  95.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 205 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 205 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 189 aa  88.6  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  86.3  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 205 aa  84.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 211 aa  84.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  24.19 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  27.06 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  27.98 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  19.46 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  25.29 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  26.67 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  22.83 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  17.13 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  18.99 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  18.44 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  17.88 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  25 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  20.44 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  19.67 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  17.88 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1766  putative transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000199447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  18.44 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  24.72 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  19.66 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  46.3 
 
 		 218 aa  51.2  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  22.65 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 235 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  21.11 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  23.88 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  42.65 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 184 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  28.35 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>